114 Jahre lang leitete der liebenswerte, aber verrückte Edward Magorium das magische Spielzeuggeschäft `Mr. Magoriums Wunderladen'. Nun will er sich zur Ruhe setzen. Die junge Molly Mahony soll seine Nachfolge antreten und den Laden übernehmen. Doch je näher sein letzter Tag rückt, desto grauer und dunkler wird das Geschäft. Um den Laden zu retten, muss Molly nämlich zuerst die Magie entdecken. Hilfe bekommt sie dabei von dem schüchternen Henry.